2007年11月7日，南京大学与日本国家材料研究所签署了全面合作协议书（MOU），正式建立关于“太阳能转化与环境净化的材料研究”的长期项目合作关系。此项合作源于2004年6月4日，我中心和日本国家材料研究所环境材料研究中心签署的合作协议书，建立在双方长期深入合作的关系基础之上。双方围绕共同申请中日双方的科研项目，联合培养硕士、博士研究生，互派科研人员到对方研究中心开展研究工作等内容展开实质性的合作。双方合作的长远目标是在不远的将来，推动和促进有关太阳能转化与环境净化的高技术成果的产业化。根据全面合作协议，被招收的学生将以南京大学和北海道大学博士生的身份在日本国家材料研究所完成实验研究，毕业将获得南京大学和日本北海道大学双博士学位，双方联合培养学生的模式得到进一步发展。截至2012年，通过联合培养毕业的学生以达到6人，正在接受教育的4人。
